- Las Apps es recomendable que estén en la carpeta Aplicaciones (es un asunto de permisos y seguridad).
- Aunque pueden estar donde mejor creas, pero el instalador (si lo tiene) debe permitirte esa opción.
- Muchas Apps no permiten ser instaladas en discos duros formateados sensibles a mayúsculas/minúsculas.
- Muchas Apps además de los ficheros propios de la App instalan archivos en la carpeta del usuario.
- No es recomendable usar un disco duro de backup para otra cosa, si además es de Time Machine de eso que tengas de más no se hará copia de seguridad.
- No es recomendable instalar Apps en disco duros externos porque el disco duro puede no estar en algún momento.
En definitiva:
El disco de copia de seguridad... que siga siendo de copia de seguridad.
Si tienes problema de espacio, las cosas grandes (las bibliotecas (música, fotos, vídeos, etc...), documentos de trabajo, etc...) son los que deben sacarse del disco duro interno. Mejor, como ya te dicen, es que sea un disco duro rápido. El de la copia de seguridad da igual, pero el de trabajo no.