cambio de disco duro nuevo

Hola queria haceros una consulta, mi macbook pro con 2 unidades de disco una ssd y un hd normal de 500gb, en la unidad hd siempre la usé para datos y demas, y la ssd para el sistema opertivo del mac.

La semana pasada por rotura del disco de datos tuve que cambiarlo y aproveche y puse uno de 1tb, como aun el disco antiguo funcionaba, con una aplicacion de clonar discos hice una copia exacta del disco antiguo, mi pregunta viene cuando por parte de mi trabajo (soy Dj) el itunes y tracktor no encuentran la musica que se encontraba en el hd antiguo, siendo la copia exacta de lo que tenia, sin embargo si conecto a traves de una caja de discos externa el disco aniguo empieza a aparecer la musica desde ahi,

No se si me explicado con claridad

espero me podais echar un cable