Hola, espero que tengas un buen día.
Entiendo que cuando bajas el volumen multimedia también te está bajando el sonido de las alertas y notificaciones.
Es importante que entiendas que ambos son sonidos diferentes, y el control del alto de este sonido puede ser controlado juntamente o independientemente.
Para configurar el sonido de las alertas debes ir a Configuración > Sonidos y Vibración, allí te aparece la barra que indica el nivel del sonido de para el timbre y las alertas, y lo puedes graduar tu mismo.
Allí aparece una opción llamada "Cambiar con botones", si está activada, cuando uses los botones al lateral de tu iPhone para cambiar el sonido se podrá modificar también el alto del sonido para el timbre y alertas, pero esto solo será si tu iPhone en ese momento que lo hagas no está reproduciendo algún sonido, sea de un videojuego, vídeo o canción, dado que si estas reproduciendo algún sonido, el sonido que cambiará será el del multimedia.
El sonido que puedes modificar al abrir el centro de control es el sonido multimedia, allí no se modifica el sonido del timbre y alertas.
Esto es fácil de verificar, que sonido estás graduando, cuando sea el tono del timbre o alertas, el cuadro del volumen (el que aparece al pulsar los botones de sonido de tu iPhone) dirá en la parte superior "Timbre", de lo contrario dirá "Volumen".
Si te parece muy complejo esto, puedes desactivar la opción que te mencioné, así al pulsar los botones de sonido del iPhone no se modificará en ningún momento el tono del timbre y alertas.
Espero mi respuesta te haya ayudado, de igual manera quedamos atentos a tus respuesta y validación de la solución.
Que tengas un buen día.