por mucho que ponga el usuario y la contraseña que me solicita macOS para hacer cambios, me sigue saliendo el mismo mensaje, sin posibilidad de usar mi certificado digital.

Para poder hacer cambios en el mac debes tener una cuenta de administrador y escribir la clave del mac

En acceso a llaveros se encuentran los certificados digitales, tu certificado personal debe estar en "inicio de sesión", el certificado de la FNMT yo lo tengo en "inicio de sesión" y "raiz del sistema"

Todos los certificados deben estar en modo "confiar siempre" en el apartado confiar, haces doble clic en el certificado para acceder a la confianza.

Si todo va bien, los certificados funcionarán en safari

Independientemente puedes cargarlos en Firefox, que tiene su propio motor de certificados. Aunque también lee los de acceso a llaveros.