Mail de Big Sur errático

Puedes seleccionar los buzones que te dan problemas y en el menú Buzón selecciona Reconstruir.

También puedes eliminar las cuentas de correo y volverlas a añadir.

O puedes probar la forma bruta de resolver los problemas de Mail:

1. Reinicia el ordenador y no trates de abrir Mail.
2. En el menú del Finder Ir > Ir a la carpeta copia y pega: ~/Library/Mail/V8/MailData
3. En la ventana MailData que se abre, ordena los archivos por nombre.
4. Borra todos los archivos que empiezan por Envelope Index
5. Borra todos los archivos que empiezan por ExternalUpdates.storedata
6. Abre Mail, se reconstruirán las bases de datos de tus correos.

Seguro que hay algo más que se puede hacer pero el problema es saber qué.

He encontrado un blog que recopila problemas con mensajes desaparecidos al trasladarlos, empezó en Catalina pero, también sigue en Big Sur:

https://mjtsai.com/blog/2019/10/11/mail-data-loss-in-macos-10-15/

Parece que depende del tipo de cuenta, y que no sucede en el correo iCloud. Algunas personas perdieron miles de correos al actualizar. Y que trasladar correos entre distintas cuentas puede hacer que no solo se pierdan en el mac, sino que se borren del servidor de correo. Pero no apuntan a una solución.