Boa tarde HelomValentim, tudo bem?
Primeiramente, verifique se você tem um hardware oficial de licenciado do Windows 8.1. Um software pirata não funcionará.
Em segundo lugar, não tem problema fazer através do Pen Drive, contanto que o Assistente do Boot Camp o oriente a fazer isso. Faça tudo exclusivamente pelo Assistente, não particione seu disco pelo Utilitário de Disco. O Boot Camp não pode ser instalado se houver mais de uma partição no seu Mac.
Baixe a imagem ISO do site da Microsoft e então inicie o Assistente. Tenha uma unidade Flash USB de 32GB ou mais de espaço para instalar o Boot Camp nele. Depois disso, o próprio assistente vai iniciar o Mac pelo Windows.
Qualquer dúvida volte a postar, espero ter ajudado!
AppleGorgon