Creio que você esteja confundindo um pouco as coisas.
O iCloud em si não é exatamente uma ferramenta de armazenamento, mas mais uma ferramenta de sincronização.
Qual a diferença entre armazenamento do dispositivo e armazenamento do iCloud? - Suporte da Apple
Há informações que não são armazenadas no iCloud, como conteúdos internos de aplicativos. Atualmente é muito comum que as pessoas tenham históricos homéricos de WhatsApp, inúmeras fotos salvas no Instagram, isto são coisas que estão no banco de dados do aplicativo, que fica no aparelho, não no iCloud.
As ferramentas que utilizam o iCloud como banco de dados são basicamente as da Apple, como Mail, Fotos, Notas, Contatos, estas informações podem ser otimizadas pelo sistema para ficarem armazenadas lá, com os dispositivos contendo apenas amostras destes itens, que serão baixados do iCloud quando o usuário clicar/tocar neles.
Os demais aplicativos utilizam suas próprias sandboxes no aparelho para armazenamento. Você pode salvá-las nas estruturas básicas do iOS (Fotos, Arquivos, etc.), mas via de regra eles ficam sempre completos dentro do app, armazenados localmente.