.....und die Dateien umständlich im Finder aus dem Verzeichnis von TimeMachine holen.
Na ja, vielleicht etwas übertrieben.
Die Tatsache, dass die Wiederherstellung im safe mode funktioniert, zeigt, dass es nicht an TM liegt, sondern an etwas, das im safe mode eben nicht aktiv ist. Und das sind vor allem Startobjekte und Virenscanner. Dass das erst seit BigSur und Monterey aufritt und vorher nicht, hat in diesem Zusammenhang nichts zu sagen. Apple führt an neuen OS-Versionen immer auch Änderungen durch, die nicht dokumentiert sind.
Es ist ein vglw geringer Aufwand die Startobjekte zu deaktivieren (da muss nur das Häkchen raus) und das Verhalten zu testen. ClamX war mal vor Jahren ein halbwegs brauchbarer Virenscanner - ja, auch für OSX/macOS -, seit die Geld dafür wollen und neuere macOS-Versionen auf dem Markt sind, nehmen die aber auch am Wettbewerb für nutzlose Software mit ganz vorne teil. Das Geld kann man besser woanders anlegen.
Mir wäre es meine eigene Überzeugung nicht wert, etwas so Elementares wie ein Backup zu riskieren, nur "weil es doch vorher ohne Probleme funktioniert hat". Im Desaster-Fall hast du keine Lust mehr, darüber nachzudenken, was nun das Richtige ist. Dann muss es funktionieren. Und zwar auf Anhieb.